В XVII веке два священника-иезуита подвергаются насилию и преследованиям во время странствия по Японии, куда они приехали с целью найти своего наставника и распространять христианское Евангелие.

Япония, 1614 год… Под властью сегуна Такугавы в стране воцаряется мир. На протяжении 400 лет жители двух удаленных деревень Ига и Кога совершенствуют свое уникальное боевое искусство - синоби. Оба клана - давние враги, но пока их сдерживает перемирие. Однако сегуну не нужны сильные подданные. Он стравливает ниндзя, пообещав победителю власть. Перемирие нарушено… Тем временем наследники местных правителей влюблены и тайно встречаются. Их любовь могла бы принести мир враждующим сторонам, но волею судеб возлюбленные становятся противниками…

Япония. 1868 год. Дочь самурая, юная Охару (Кинутиё Танака), - дежурная фрейлина во дворце сёгуна. Высший свет имперской знати, богатые ухажёры и благородные военачальники - всё рухнуло в тот самый миг, когда она позволила себе любовь. Любовь с придворным низкого ранга, любовь с телохранителем самого правителя. За скандальную связь возлюбленного обезглавливают, а её вместе с семьёй изгоняют из столицы. Жизнь Охару покатилась вниз и впереди - только хроника бесчисленных падений из-за мужчин, путь от наложницы сёгуна до дешёвой уличной проститутки.

Озлившись на то, что юный Асано не хочет одаривать подарками представителей знати, старый церемониймейстер подставляет его, заставив вынуть меч из ножен в доме Сегуна. Асано делает харакири, а его клану суждено сгинуть. Но управляющий Оиси придумал план, благодаря которому можно не только спасти клан Асано, но и отомстить Сегунату, казнившему его хозяина.

Япония XIX век. После прибытия "черных кораблей" командора Перри страну охватывает смута. Спустя несколько лет небольшой отряд ронинов направляется в Киото, чтобы поступить на службу к сегунату. В центре истории - Исами Кондо, смелый воин, возглавивший патриотически настроенную группу ронинов из которых правительством было сформировано подразделение, призванное сохранять порядок в столице - шинсенгуми (новое ополчение). Но в самом шинсенгуми некоторые понимают "сохранение порядка" по своему...

Для подготовки воинов к возможным нападениям иностранных захватчиков проводят марафон: 58 километров по горным тропам. Вассалы присоединяются к состязанию, чтобы получить обещанный приз. Тем временем правительство Эдо ошибочно принимает марафон за государственную измену и направляет к «предателям» наёмных убийц. Дзиннаи Карасава выглядит как обычный самурай, однако на самом деле он - шпион центрального правительства. Дзиннаи узнаёт о недоразумении и, чтобы остановить убийц, начинает отчаянный забег.

Ванг Конг, однорукий меченосец из Китая, спасает от смерти маленького мальчика, случайно оказавшегося на пути самурайской процессии. Не потерпевшие вмешательства самураи хватаются за мечи, что приводит к гибели нескольких крестьян. Стремясь уничтожить всех свидетелей этой бойни, убийцы начинают охоту за Вангом Конгом. Тем временем Затоичи знакомится с мальчиком, которого спас Ванг Конг. Его отец стал одной из жертв самурвев, и перед смертью он просит Затоичи позаботиться о его сыне. Взяв его с собой, Затоичи вновь отправляется в странствия и вскоре встречается с Вангом Конгом. Не доверяя своему новому знакомому, за голову которого назначена награда, Затоичи не знает, что стравить их между собой выгодно местному боссу, который видит в этом хороший способ увеличить свое влияние. Двое отважных воинов говорят на разных языках и в конце концов окажутся по разные стороны баррикад в битве, в которой выживет только один.

Окацу - приемная дочь известного мастера меча. Она в совершенстве познает боевые искусства и ее приемному брату Ринтаро кажется, что отец любит ее сильнее, чем его, родного сына. Ринтаро уходит из дома и, будучи азартным игроком, попадает в неприятность. Глава местного управления хочет отомстить отцу Окацу за старые обиды и использует эту ситуацию в своих нуждах (хозяин игрового дома - его приятель). Он обменивает сына на отца, жестоко пытает его до смерти и насилует Окацу. Вырвавшись из плена, она планирует месть и приступает к ее осуществлению. На ее пути встает профессиональный убийца - охотник за головами.

Фильм состоит из двух частей: в первой рассказывается история конфликта князя Асано Наганори, богатого даймё замка в Ако, и церемониймейстера при дворе сёгуна князя Кира Кодзукэноскэ, в результате чего князь Асано напал с мечом на Кира в замке сёгуна во время визита императорских послов и затем был вынужден совершить сэппуку. Во второй части перед нами уже рассказ о вассалах погибшего князя Асано, ставших ронинами, и в первую очередь о бывшем управляющем его замка Оиси Кураноскэ. Это рассказ о мести самураев за своего господина, о долге чести и преданности, о следовании кодексу бусидо, несмотря ни на какие преграды.

В 1860 году, у ворот Сакурада в Эдо, убивают премьер-министра Ии Наоске. Позор и ответственность за это принимает на себя Симура Кинго, обещавший князю защитить его своей жизнью. Он ищет последнего выжившего убийцу, чтобы положить его голову на могилу своего господина. Но времена меняются, происходит Реставрация Мэйдзи, путь меча не в чести теперь и объявлен вне закона. Что это означает для Симуры Кинго?

250 лет тому назад Соэцу, мелкий ростовщик, убит жестоким самураем Синдзаэмоном, который схоронил его тело в Касанэ-га-фути — омуте извилистой реки, где, согласно местным поверьям, тот, кто упадёт в воду, никогда не всплывет на поверхность. Двадцать лет спустя Синкити, красавец сын Синдзаемона, случайно знакомится с Тоёсигой, дочерью Соэцу, и они влюбляются друг в друга. Однако Тоёсига становится жертвой странной болезни, и Синкити вскоре обнаруживает, что не в силах избавиться от её нетленной любви к нему, несущей, точно проклятие, страдания и смерть.

Продолжая бездельничать, Гинтоки, Синпати и Кагура сталкиваются с недостатком денег и уже задолжали ренту за три месяца. Тогда они решают устроиться на работу, но выбирают для этого странные места и везде натыкаются на сёгуна. А в это время в рядах Синсэнгуми зреет раскол — заговорщики внедрили Хидзикате чип, подавляющий волю, и планируют убить начальника полиции Кондо.

История Иэмона Тамии, обедневшего самурая, бывшего ронина, только что поступившего на службу к даймё. Когда его господин делает харакири по приказу сёгуна Иэмону тяжело принять выбор между долгом и стремлением к лучшей жизни. Иэмон давно лишился родителей и познал все тяготы жизни ронина. Тамия встретил девушку и полюбил её, девушка доверилась ему. Однажды, внучка знатного господина из враждебного клана, повинного в смерти даймё, тоже влюбляется в Тамию Иэмона. Образовавшийся любовный треугольник добавляет драмы и борьбы страстей, когда клан Иэмона предпринимает месть за своего господина.

1865 год. Сёгунат доживает последние годы, но еще способен наказывать своих врагов. Один из них — наемный убийца по имени Изо. Он находится на службе у правителя княжества Тоса, выступившего против дома Токугава. Изо убивает множество самураев сёгуна, но попадает в плен и умирает мучительной смертью. В последнее мгновение сила ярости переносит Изо через пространство и время в современный Токио, где он оказывается среди городских бомжей. Здесь он превращается в новую, усовершенствованную смертоносную машину, а душа Изо, разгневанная муками прошлой жизни жаждет отмщения. Его ответ власть имущим, предшественники которых, казнили его — меч.

Любовь непостоянна как море. Никто не предскажет, что случится с ними через час. Даже через минуту... О-Ши, гейша из приморского города, знает об этом, но что стоят красивые слова о чувствах в ее мире, где суровые обычаи и традиции считаются важнее голоса сердца? Как-то раз на ее пороге появляется самурай по имени Фусаносуке. Он находится в бегах после совершенного им убийства, и О-Ши соглашается укрыть его у себя. Вскоре между героями разгорается жаркий роман, кажется, что в этом костре страстей пылает пламя истинной любви, вот только удержит ли его тепло мужчину? Однажды Фусаносуке уходит, вернется ли он? Лишь море, изменчивое и непостоянное, как человеческое сердце.