Родился 17 июня 1943 г. в г. Колпашево (Томская область), где отец, Меркурьев Василий Васильевич, актер, был директором Нарымского окружного драматического театра, а мать, Мейерхольд Ирина Всеволодовна, главным режиссером этого театра. В семье было уже пятеро детей: две родных сестры и трое племянников репресированного дяди. После реэвакуации в Ленинград учился в средней школе №203 и в музыкальной школе. В 1960 поступил в музыкальное училище при Ленинградской консерватории на теоретико-композиторское отделение. В 1965 уехал в Москву, где закончил дирижерско-хоровое отделение Музыкального училища при Московской консерватории. В 1967 поступил в Московскую консерваторию на дирижерско-хоровой факультет, но из-за того, что уже работал в Детской хоровой студии «Весна« (ныне - всемирно известный детский хор «Весна», обладатель 17 главных наград на международных конкурсах и дважды получавший Гран-при Европы и Гран-при Мира), вынужден был перевестись на заочное отделение Харьковской консерватории, которую окончил в 1970 (тогда она уже стала институтом искусств). Работал педагогом в Детской хоровой студии «Весна», а с 1974, по приглашению Д.Д. Шостаковича, Д.Б. Кабалевского и Т.Н. Хренникова, стал работать в Союзе композиторов СССР председателем комиссии по музыкально-эстетическому воспитанию детей и юношества. В 1989 Т.Н. Хренников (председатель СК СССР) назначил П. Меркурьева главным редактором основанной им газеты «Музыкальное обозрение». Этот пост через год (в 1990 г.) уступил своему ученику Андрею Устинову (ныне - заслуженный деятель искусств России, кавалер многих орденов), а сам стал работать его заместителем. В этой должности пребывает и сейчас.

С 1959 снимается в кино, снялся более чем в 90 фильмах. Имеет международные призы «за лучшую роль». Написал книгу «Сначала я был маленьким», посвящённую родителям. Книга выдержала два издания. Заслуженный деятель искусств России (2001 г.).