Основан во время контрреформации в 1658 г. Вначале, как полагают, был возведен деревянный храм на возвышенном берегу реки Мемеле. Строительство каменной, прямоугольной в плане, шестистолпной, трехнефной базилики с полукруглой апсидой было начато, возможно, ок. 1666 г., когда при костеле был основан монастырь иезуитского ордена; окончено в 1692 г. Западный фасад костела решен как вариант южнонемецкого барочного двухбашенного храма с вытянутым на всю высоту среднего нефа центральным ризалитом. Своеобразны сдержанность наружного архитектурного декора и отсутствие типичной для барокко пластической разработки ордерных мотивов. Интерьер выделяется пространственной цельностью и строгой тектоникой архитектурных форм, близкой образцам итальянского Ренессанса. Характерен развитый ритм горизонтальных членений среднего нефа, акцентированных балюстрадой балкона, размещенного под сводами на полочке венчающего карниза. Слабо увязана с суховатым рисунком архитектурных деталей интерьера композиция грандиозного центрального ретабло (общая высота 12 м), богато украшенного в типичной для барокко пышной манере двумя ярусами коринфских колонн, разорванным фронтоном, грузными скульптурами апостолов свв. Петра и Павла, живописью, гирляндами и ажурными завитками аканта. Костел мало пострадал от позднейших перестроек: сохранились проспект органа, кафедра, боковые алтари и другие предметы внутреннего оборудования конца XVII-XVIII в. В 1852 г. старое завершение башен было заменено новым (выполнено плотником К. Брахманом). Кровля и башни были частично разрушены во время первой и второй мировых войн, после чего венчание центрального ризалита и обеих башен осталось невосстановленным.

© В. Чантурия, Й. Минкявичюс, Ю. Васильев, К. Алттоа, Белоруссия-Литва-Латвия-Эстония, «Искусство», М., 1986 г.