Симптомы вы правильно описали, но диагноз неверный поставили. Примечания в субтитрах - это роспись переводчика в том, что он не справился. Так что это не аниме сделано для японцев, а просто плохой перевод.

Ну, я себе слабо представляю как можно справится с адаптацией шутки, построенной на игре слов, написании иероглифов или про известных японских личностей, имена которых впервые слышишь =)

Игра слов на японском заменяется игрой слов на русском, а известные японские личности - на известные российские или мировые личности. Хотя, это только на словах просто, но требует больших усилий от переводчика. В противном случае - "нет более жалкого зрелища, чем человек, объясняющий свою шутку". Комедия с примечаниями - это уже не комедия, а совсем другой жанр, а если твой перевод меняет жанр, то лучше вообще не браться за перевод, а зрителю, соответственно, не садиться за просмотр.

Будет прикольно прочитать в диалогах японских девочек обсуждение Баскова или там Германа Грефа ^_^

Когда прикольнее, чем читать в диалогах обсуждение какого-нибудь Кавасаки, а потом комментарий на половину экрана о том, что это японский Басков. Понимаете, в контексте комедии неважно чем этот Кавасаки отличается от Баскова, важна шутка, связанная с условным поп-певцом или условным олигархом, а не их личности. Это ведь не исторические персонажи и аниме не про исторические события.

Ну, в целом тоже верно, но тогда возникает некое ощущение диссонанса, как от перевода ANCORDа. Не ясно это адаптированная шутка или автор перевода забил и просто прикалывается -_-

Ну, если продолжать идею с Анкордом, то адаптация шуток идеально подойдёт для дубляжа аниме. В субтитрах будет бросаться в глаза, что обсуждают Кавасаки, а написано про Баскова, что, собственно, исключает дубляж.

Ну а что, зрители, смотрящие с субтитрами, не люди? Шутки без адаптации - не шутки вовсе. Вы это прекрасно объяснили в своём отзыве. Я не знаю что там у Анкорда, балуется он в озвучке или нет - не слушаю, но если вы доверяете переводчику, то знаете, что если он меняет Кавасаки на Баскова, значит смысл в том, что это просто популярный поп-певец, а не конкретный поп-певец чем-то примечательный. Задача переводчика - донести смысл, а не рассказать зрителю кто такой Кавасаки.
Вообще, конечно, комедия - это наверное самый зависимый от качества перевода жанр. Например, если бы Лаки Стар достался какому-нибудь фансаберу Васе Пупкину, который переводит слово в слово и пишет километровые примечания, мы бы наверное сейчас даже и не вспомнили, что была такая комедия.