Видимо, понимая проблемы с логикой/
в сериале с логикой всё в порядке

Зачем в операции нужен маньяк, если охрану убивать нельзя/
охрану - да, а палачей? В аниме ясно было сказано: лишняя боевая единица не помешает.

Почему нельзя было похитить груз до его погрузки?/
как смог паренёк организовать себе с сестрой помощь, так и организовал. Значит не было у него возможности сделать это раньше, до посадки на поезд. Организовать такой план побега, да ещё найти и нанять нужных исполнителей за 5 минут не делается.

Если появление шпаны и мошенницы не входило в планы, то почему от них не избавились еще в тюрьме?/
Кошка же сказала, что раз они оказались в нужное время в нужном месте и прошли со всеми остальными испытание на пригодность, значит, они достойны здесь находиться. Что-то в этом роде.

Маньяк убивает всех подряд просто потому, что ему это нравится./
В первой половине сериала - не всех подряд. Команду, в которой находится не трогает, да и Мошенницу оберегает от неприятностей.

Палачи и вовсе большей частью выступают статистами/
Особенно учитель с ученицей)

что стало с остальным миром, помимо Канто и Кансая, мы так и не узнаем/
А зачем? Команда выполнила свою работу, дети спасены. Какая разница в каком мире они окажутся, это не суть произведения. Дело сделано - занавес закрыт. Кстати, воевали Канто с Кансаем, значит, остальной мир должен быть в норме, мост и ворота это демонстрируют.

Как защитники порядка могут быть хуже преступников/
Я бы не сказала. Толпа начала массово убивать всех, кого посчитала акудамой, начались беспорядки. Самосуд всегда преследовался законом. Акудама - человек, нарушающий закон. Самосуд толпы, погромы - нарушение закона. Босс правильно сделала, что обозначила всех бунтовщиков акудамами. Ведь это были не мирные демонстрации, население было вооружено и применяло даже зажигательные смеси. А то, что произошло в конце - это хитрый трюк Мошенницы, она нарочно спровоцировала бунт народа против палачей. Способность Мошенницы - находить выход из трудных ситуаций, поэтому она и осталась в команде с разрешения кошки.

А вот то, что телефон вырубил в нужное время всеобщее электричество - это чистой воды рояль в кустах (кораблик сразу сбился).

"Особенно учитель с ученицей"

Поле смерти учителя, ученица большей частью как наблюдатель стала выступать. Остальные палачи и вовсе появлялись, чтобы быстро кого-нибудь убить или умереть самим.

"А зачем? Команда выполнила свою работу, дети спасены."

Потому что непонятно почему все рвутся в Канто, рискуя погибнуть в поезде, но не бегут в другие провинции. В финале можно предположить, что остальному миру пришел конец, но тогда не понятно как процветает Кансай.

"Толпа начала массово убивать всех, кого посчитала акудамой, начались беспорядки."

Толпа пыталась защититься от преступников. И вот очередная глупость. Логичнее было запереться дома, а не выходить на баррикады с палками. И заметьте, полиция даже сотрудничала с бутовщиками, а потом резко сделала всех преступниками и казнила их. А народ даже не возмутился этому. Зато казнь "невинного" вызвало новое восстание. А побег на поезде? Разве обычный человек, узнав что в городе орудует маньяк, бросит все и решит сбежать из города, рискуя умереть еще больше?

"Способность Мошенницы - находить выход из трудных ситуаций"

У мошенницы изначально не было способностей, в первой части она больше шумела и хваталась за голову, это уже потом она научилась хоть как-то планировать свои действия.

Согласен, что у товарищей с логикой и миром огромная дыра. Всё остальное очень круто. Подумал: а где ещё у меня были такие вопросы к сюжету? - Эрго Прокси. Но чёрт возьми - там на многие из них ответили в ходе повествования. Кто-то скажет "Чего вы хотели от такого короткого сериала?" - я хотел, чтобы хотя бы сделали так, как в GitS - общими словами что с миром. Почему население ведёт себя так как будто на кону не стоит выживание человечества? Я бы не сказал что люди расслаблены или они вымирают, им просто по барабану - это не естественно для людей, так не работает, люди всем своим нутром всю жизнь желают выбраться за горизонт, их никогда не удержать в клетке, история настоящего мира это прекрасно показывает.